Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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