Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC013489.3-201ENST00000623274 517 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms