Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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ECM1Q16610 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ECM1Q16610 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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