Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PKD1L2-203ENST00000525539 7379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FAT3-206ENST00000533797 7894 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms