Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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