Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms