Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HTR4Q13639 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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