Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL1Q13616 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL1Q13616 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL1Q13616 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL1Q13616 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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