Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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