Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TMPOP42166 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TMPOP42166 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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