Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
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