Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC087521.2-203ENST00000530450 593 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC005842.1-201ENST00000537149 678 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 FLVCR2-202ENST00000539311 1221 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 FLT1-205ENST00000543394 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 NBPF5P-202ENST00000545941 1032 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC004801.5-201ENST00000552958 550 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC106028.1-201ENST00000554322 526 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 PABPN1-208ENST00000557702 778 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 ULK4P3-201ENST00000563895 440 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 FRG2GP-201ENST00000567870 615 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC004147.5-201ENST00000581727 536 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AP001017.1-201ENST00000591378 482 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 LAMTOR5-AS1-211ENST00000598350 749 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC004840.2-201ENST00000603368 285 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC097534.2-201ENST00000609153 751 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.101-201ENST00000611704 303 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.162-201ENST00000613066 277 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 LINC01835-203ENST00000639800 567 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 OVGP1-201ENST00000369732 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 C8orf44-201ENST00000390159 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 METTL7A-201ENST00000332160 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC023790.2-201ENST00000543321 2403 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 ANKFN1-202ENST00000566473 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 BTN2A3P-204ENST00000466808 2559 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 CR786580.1-201ENST00000417843 2878 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 LINC01410-201ENST00000424345 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 NLRP1-210ENST00000572272 4422 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 HELQ-204ENST00000510985 3315 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 FBXL2-222ENST00000538892 2793 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 WBP11P1-202ENST00000567636 2972 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 SLC9B2-204ENST00000503230 1826 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 UNC5D-205ENST00000449677 2448 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 GIGYF2-204ENST00000409480 5976 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 PIBF1-201ENST00000326291 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 IGFL3-201ENST00000341415 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 RNU1-7P-201ENST00000364105 164 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 SNORD88A-201ENST00000408314 91 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 RPL36A-HNRNPH2-201ENST00000409170 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 TTLL11-IT1-201ENST00000411790 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 DMKN-205ENST00000414866 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 MED15P4-201ENST00000417579 393 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 LINC01399-201ENST00000423311 648 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 SNRPCP1-201ENST00000433292 458 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC005588.1-201ENST00000439168 162 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 ZEB1-AS1-203ENST00000441257 585 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 LINC01696-201ENST00000448988 492 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 PRMT8-203ENST00000452611 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 RN7SL800P-201ENST00000484823 280 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AL590867.2-201ENST00000492974 447 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC091940.1-204ENST00000507318 3091 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AL645949.1-201ENST00000510094 324 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC106794.2-201ENST00000513713 632 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC024451.3-201ENST00000517810 463 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC100849.1-203ENST00000518417 723 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 ZNF252P-203ENST00000527222 876 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXB1P14653 AP002360.1-204ENST00000529331 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms