Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms