Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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