Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms