Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms