Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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