Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EFNB3Q15768 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms