Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAM2Q15035 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms