Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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