Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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