Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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