Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CHAF1BQ13112 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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