Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRAF1Q13077 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms