Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RN7SL118P-201ENST00000580570 302 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RN7SL726P-201ENST00000605957 299 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC005291.2-201ENST00000609088 523 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 HIST1H4G-201ENST00000611444 297 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.208-201ENST00000629083 297 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RAPGEFL1-201ENST00000264644 3429 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZNF627-204ENST00000588174 2755 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TMPRSS13-207ENST00000528626 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TPP1-201ENST00000299427 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 WRAP53-201ENST00000316024 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 DYNC1I1-206ENST00000457059 2393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 FAM92A-206ENST00000518322 4241 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PASK-202ENST00000358649 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ACTG2-202ENST00000409624 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PBRM1-201ENST00000296302 5145 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TRAFD1-202ENST00000412615 2697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL117258.1-201ENST00000637218 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CD22-201ENST00000085219 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PSTPIP2-201ENST00000409746 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ST5-213ENST00000526757 3019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZNF16-209ENST00000611477 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 FAXC-201ENST00000389677 11508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SLC25A14-214ENST00000545805 1650 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TMEM33-203ENST00000504986 7482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 BNIPL-203ENST00000368931 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RUNX1T1-204ENST00000422361 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 KCNE1B-202ENST00000618699 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC011479.3-201ENST00000594299 1890 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RHOXF2-201ENST00000371388 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL590617.1-201ENST00000405630 748 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RPL12P14-201ENST00000431782 490 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL731567.1-201ENST00000435635 462 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 GAPDHP74-201ENST00000449411 625 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RN7SL78P-201ENST00000495193 281 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC233724.2-201ENST00000515727 271 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AP002991.1-201ENST00000539305 574 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TRBV7-1-201ENST00000547918 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC048337.1-201ENST00000557474 552 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MAST2-203ENST00000372009 4047 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 R3HDM2-202ENST00000358907 3974 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 HERC2P4-205ENST00000566902 3957 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 HAP1-201ENST00000310778 4087 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MFSD4A-201ENST00000367147 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TAF2-201ENST00000378164 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 BHLHB9-201ENST00000361229 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CD226-206ENST00000581982 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 HACL1-201ENST00000321169 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms