Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms