Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ELF5-201ENST00000257832 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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NFKB1P19838 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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NFKB1P19838 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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NFKB1P19838 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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NFKB1P19838 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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