Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms