Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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