Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PFDN4Q9NQP4 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms