Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CLDN19Q8N6F1 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CLDN19Q8N6F1 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CLDN19Q8N6F1 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CLDN19Q8N6F1 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CLDN19Q8N6F1 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CLDN19Q8N6F1 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLDN19Q8N6F1 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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