Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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RTL8BQ17RB0 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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RTL8BQ17RB0 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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RTL8BQ17RB0 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTL8BQ17RB0 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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