Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC068152.1-202ENST00000571901 808 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CTF1Q16619 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms