Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ZNF56Q15929 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms