Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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VPS72Q15906 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
VPS72Q15906 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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