Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SIX1Q15475 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SIX1Q15475 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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