Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms