Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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