Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CNGB1Q14028 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
CNGB1Q14028 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms