Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CACNA1SQ13698 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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