Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDH18Q13634 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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