Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
EIF4EBP1Q13541 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms