Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PICALMQ13492 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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