Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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ITGB3BPQ13352 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGB3BPQ13352 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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ITGB3BPQ13352 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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ITGB3BPQ13352 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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