Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 393.8 ms