Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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IFT88Q13099 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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IFT88Q13099 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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IFT88Q13099 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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IFT88Q13099 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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IFT88Q13099 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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