Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms