Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
E2F1Q01094 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms