Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FAM3AP98173 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms