Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TTPAP49638 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms